紫外线**器作用是通过微生物体内的脱氧核糖核酸吸收紫外光线来完成。*大吸收值分别是在波长200nm和265nm，而不是人们通常认为的来自低压灯的254nm。波长为200nm的紫外光，主要是被**脱氧核糖核酸的核糖和磷酸盐所吸收。而波长为265nm的紫外线主要被核酸中的腺嘌呤，，胞核嘧啶和胸腺嘧啶（核糖核酸中的）所吸收。在吸收紫外线辐射以后，胸腺嘧啶二聚物是*为常见的产物。这种产物是由两个相邻的胸腺嘧啶分子结合而形成的。紫外线**的原理就是在于，这些二聚物和另外一些光化产品可以阻**氧核糖核酸的复制和再繁殖，从而达到杀死细胞的目的。
另外对于脱氧核糖核酸和核糖核酸，紫外线能够引起细胞内的蛋白质、酶和其他分子的光化学反应。蛋白质的吸收峰值大约在280nm左右，然而在蛋白质中的缩氨酸根则吸收240nm以下的紫外线。紫外线也对其他的不饱和生物分子有杀伤力，例如：辅酶、***和电子负载体。当然，紫外线对分子的影响，不仅仅作用于脱氧核糖核酸和核糖核酸，它对大一些的微生物也有显著的作用，例如**类、原生动物和藻类。虽然紫外线不能像作用于脱氧核糖核酸一样，刺穿这些较大的微生物，但是它还是能用破坏其他分子的方法达到**效果。
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